Издательство «Никéя» основано в 2008 году в Москве при храме Рождества Пресвятой Богородицы в Крылатском.
Первые книги издательства — православный молитвослов «Дивен Бог», канон Андрея Критского и уникальная полноцветная «Азбука» Е.А. Слободской.
В 2009 году издательством выпущено 12 книг, среди которых популярный сборник притч «Жил человек». Наиболее интересные проекты года: начало серии «Богословие для всех», которую открыла книга проф. А.Б. Зубова «Лекции по Истории религий»; книга духовника московского священства прот. Георгия Бреева «Радуйтесь!»; первое после 1917 года переиздание воспоминаний о старце Амвросии Оптинском писателя Е. Поселянина; «Толкование на Апокалипсис» прот. Геннадия Фаста; научное издание «Диспут свт. Григория Паламы с Григорой Философом». В этом же году формируется собственный уникальный стиль издательства, суть которого в том, чтобы выпускать качественные, красивые и современные книги. Для этого издательство активно привлекает к работе известных современных дизайнеров и художников, формирует редакторский отдел. В 2009 году создан отдел оптовой торговли, расширяется ассортимент книжной продукции других издательств.
2010 год — год активного роста и построения как редакционной, так и торговой деятельности. Взят курс на повышение качества выпускаемой продукции, увеличен редакционный штат. В плане на 2010 год — более 30-ти новых книг, в том числе новые авторы, научные издания святоотеческого наследия, открытие серии современной христианской прозы.